В своей деятельности Научный центр противодействия коррупции руководствуется:

• Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами и иными правовыми актами Российской Федерации,
• Положением о Министерстве юстиции Российской Федерации (указ Президента Российской Федерации от 13.10.2004 г. №1313 в ред. от 23.10.2008 г.),
• нормативными актами Министерства образования и науки Российской Федерации,
• Уставом и локальными нормативными актами Академии,
• Положением о НИИ
• Положением о Научном центре противодействия коррупции;